A minha educação académica começou pela genética, passando pela antropologia biológica, e terminando num doutoramento em paleogenomica de populações Neolíticas e da Idade do Bronze da Europa. Tenho ampla experiência em investigação e desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para a análise genómica de populações antigas, visando especificamente a determinação de ancestralidade, avaliação fenotípica, simulações de mistura, e organização social usando técnicas de determinação de parentesco. Estou, também, envolvido no desenvolvimento de metodologias de laboratório otimizadas para ADN antigo, e protocolos para amostragem óssea.
Daniel Magalhães Fernandes
Perfil Orcid
Perfil Ciência Vitae
| Interesses de Investigação |
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| ADN Antigo |
| Paleogenomica |
| Genética das Populações |
| Bioinformática |
| Ensino |
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2019 – 2022: “Introduction to R for Anthropologists”, Universidade de Viena |
2021 – 2022: “Human Evolution, human osteology and paleogenomics”, Universidade de Viena |
2017 – 2022: “Departmentseminar Anthropologie”, Universidade de Viena |
| Principais Publicações |
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Fernandes DM, Cheronet O, Gelabert P, Pinhasi, R 2021, ‘TKGWV2: An ancient DNA relatedness pipeline for ultra-low coverage whole genome shotgun data’, Scientific Reports, vol. 11, 21262. https://doi.org/10.1038/s41598-021-00581-3 |
Fernandes DM, Sirak K, Ringbauer H, Sedig J, Rohland N, Cheronet O, Mah M, Mallick S, Olalde I, Culleton BJ, Adamski N, Bernardos R, Bravo Morante G, Broomandkhoshbacht N, Callan K, Candilio F, Demetz L, Duffett Carlson K, Eccles L, Freilich S, Jackson GR, Lawson AM, Mandl K, Marzaioli F, McCool WC, Oppenheimer J, Özdogan KT, Schattke C, Schmidt R, Stewardson K, Terrasi F, Zalzala F, Antúnez CA, Canosa EV, Colten R, Cucina A, Genchi F, Kraan C, La Pastina F, Lucci M, Maggiolo MV, Marcheco-Teruel B, Tavarez Maria C, Martínez C, París I, Pateman M, Simms TM, Sivoli CG, Vilar M, Kennett DJ, Keegan WF, Coppa A, Lipson M, Pinhasi, R & Reich, D 2020, ‘A genetic history of the pre-contact Caribbean’, Nature, vol. 590, pp. 103–110. https://doi.org/10.1038/s41586-020-03053-2 |
Sirak KA, Fernandes DM, Cheronet O, Harney E, Mah M, Mallick S, Rohland N, Adamski N, Broomandkhoshbacht N, Callan K, Candilio F, Lawson AM, Mandl K, Oppenheimer J, Stewardson K, Zalzala F, Anders A, Bartík J, Coppa A, Dashtseveg T, Évinger S, Farkaš Z, Hajdu T, Bayarsaikhan J, McIntyre L, Moiseyev V, Okumura M, Pap I, Pietrusewsky M, Raczky P, Sefčáková A, Soficaru A, Szeniczey T, Szóke BM, Van Gerven D, Vasilyev S, Bell L, Reich, D & Pinhasi, R 2020, ‘Human auditory ossicles as an alternative optimal source of ancient DNA’, Genome Research, vol. 30, no. 3, pp. 427-436. https://doi.org/10.1101/gr.260141.119 |
Fernandes DM, Mittnik A, Olalde I, Lazaridis I, Cheronet O, Rohland N, Mallick S, Bernardos R, Broomandkhoshbacht N, Carlsson J, Culleton BJ, Ferry M, Gamarra B, Lari M, Mah M, Michel M, Modi A, Novak M, Oppenheimer J, Sirak KA, Stewardson K, Mandl K, Schattke C, Özdoğan KT, Lucci M, Gasperetti G, Candilio F, Salis G, Vai S, Camarós E, Calò C, Catalano G, Cueto M, Forgia V, Lozano M, Marini E, Micheletti M, Miccichè RM, Palombo MR, Ramis D, Schimmenti V, Sureda P, Teira L, Teschler-Nicola M, Kennett DJ, Lalueza-Fox C, Patterson N, Sineo L, Coppa A, Caramelli D, Pinhasi, R & Reich, D 2020, ‘The spread of steppe and Iranian-related ancestry in the islands of the western Mediterranean’, Nature Ecology & Evolution, vol. 4, pp. 334–345. https://doi.org/10.1038/s41559-020-1102-0 |